Stellenangebot: Wissenschaftlicher Mitarbeiter (Doktorand) (d/w/m) Hämatologie, Onkologie und Tumorimmunologie bei Charité Universitätsmedizin Berlin KdöR

Arbeiten an der Charité
Die Arbeitsgrupppe / AG Neumann ist eine junge, translationale Forschungsgruppe am Charité Comprehensive Cancer Center. Im Mittelpunkt unserer Forschung stehen patientenabgeleitete Tumormodelle, mit denen wir Mechanismen der Therapieresistenz untersuchen und neue therapeutische Strategien für Patientinnen und Patienten mit Pankreaskarzinom (PDAC) entwickeln.
Das PDAC gehört zu den Tumorerkrankungen mit besonders schlechter Prognose. Gleichzeitig eröffnen neue direkte KRAS-Inhibitoren erstmals die Möglichkeit, einen zentralen onkogenen Treiber des Pankreaskarzinoms gezielt therapeutisch anzugreifen. Die rasche Entwicklung dieser Wirkstoffe und ihre zunehmende klinische Erprobung machen die Frage, warum Tumoren auf KRAS-Inhibitoren nicht oder nur vorübergehend ansprechen, zu einer hochaktuellen Herausforderung der translationalen Krebsforschung.
In unserer Arbeitsgruppe verbinden wir klinische Fragestellungen mit modernen präklinischen Tumormodellen. Hierzu nutzen wir insbesondere patientenabgeleitete Organoide, funktionelle Wirkstofftestungen sowie genetische, transkriptomische und proteomische Analysen. Ein besonderer Schwerpunkt des von der Deutschen Krebshilfe geförderten Projekts liegt auf der Aufklärung KRAS-abhängiger Mechanismen der Wirkstoffresistenz beim PDAC. Hierfür steht eine etablierte Biobank aus 36 patientenabgeleiteten PDAC-Organoiden zur Verfügung, die unter anderem unterschiedliche KRAS-Mutationen repräsentiert und zur Untersuchung intrinsischer und erworbener Resistenzen gegenüber KRAS-Inhibitoren eingesetzt wird.
Das Projekt wird in enger wissenschaftlicher Zusammenarbeit mit Prof. Dr. Reinhold Schäfer aus dem Charité Comprehensive Cancer Center durchgeführt, der als Ko-Antragsteller des von der Deutschen Krebshilfe geförderten Projekts seine Expertise insbesondere in der Wirkstofftestung mit der komplementären Expertise der molekularen Tumorpathologie einbringt. Dadurch verbindet das Projekt die Expertise der AG Neumann in patientenabgeleiteten Tumormodellen und funktioneller Wirkstofftestung mit der komplementären Expertise der molekularen Tumorpathologie.
Die Stelle im Überblick
Sie arbeiten als wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in in einem von der Deutschen Krebshilfe geförderten Forschungsprojekt zur Untersuchung von Resistenzmechanismen gegenüber KRAS-Inhibitoren beim Pankreaskarzinom. Im Rahmen Ihres naturwissenschaftlichen Ph.D.-Projekts nutzen Sie eine etablierte Biobank aus 36 patientenabgeleiteten PDAC-Organoiden, um die Wirkung von KRAS-Inhibitoren zu untersuchen und molekulare Mechanismen der Therapieresistenz funktionell zu charakterisieren. Dabei übernehmen Sie insbesondere:

• Kultivierung patientenabgeleiteter PDAC-Organoide und Durchführung funktioneller Wirkstofftestungen mit KRAS-Inhibitoren
• Funktionelle Untersuchung ausgewählter Gene, die mit einer Resistenz gegenüber KRAS-Inhibitoren assoziiert sind, mittels molekularbiologischer und genetischer Methoden
• Auswertung und Interpretation der experimentellen Ergebnisse im Kontext der molekularen Therapieresistenz
• Präsentation der Ergebnisse auf wissenschaftlichen Kongressen sowie Mitwirkung an wissenschaftlichen Publikationen
• Zusammenarbeit mit den wissenschaftlichen Kooperationspartnern und Core Facilities der Charité
• Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor.

Die Tätigkeit dient der wissenschaftlichen Weiterqualifikation mit dem Ziel einer naturwissenschaftlichen Promotion (Ph.D.). Sie bearbeiten eine klar umrissene Fragestellung innerhalb eines klinisch relevanten Forschungsprojekts mit dem Ziel, die funktionellen Zusammenhänge zwischen ausgewählten molekularen Veränderungen und der Resistenz gegenüber KRAS-Inhibitoren besser zu verstehen.
Danach suchen wir
Sie haben Freude an experimenteller Forschung, interessieren sich für innovative Ansätze der translationalen Krebsforschung und möchten mit Ihrer Arbeit einen Beitrag zur Entwicklung neuer Therapiestrategien beim Pankreaskarzinom leisten. Dabei möchten Sie experimentelle und computergestützte Ansätze miteinander verbinden, bringen idealerweise bereits erste praktische Erfahrungen mit und haben Interesse daran, Ihre wissenschaftlichen und methodischen Kompetenzen im Rahmen Ihrer Promotion weiter auszubauen. Daran anknüpfend suchen wir eine engagierte Persönlichkeit, die folgende Voraussetzungen mitbringt:

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Masterstudium in Biologie, Biochemie, Molekularbiologie, Biomedizin oder einem verwandten Fachgebiet
• Ausgeprägtes Interesse an tumorgenetischen und molekularbiologischen Fragestellungen, insbesondere an Mechanismen der Therapieresistenz beim Pankreaskarzinom
• Interesse an experimenteller Zell- und Molekularbiologie sowie idealerweise erste Erfahrungen in Zellkultur und/oder Organoidkultur
• Interesse an der funktionellen Untersuchung genetischer Veränderungen und deren Bedeutung für Therapieansprechen und Resistenzentwicklung
• Grundlegende Kenntnisse in R, Python, Shell oder vergleichbaren Programmiersprachen bzw. die Bereitschaft, diese für die Analyse biologischer Daten weiterzuentwickeln
• Motivation, experimentelle Arbeiten mit computergestützten und bioinformatischen Analysen zu verknüpfen
• Eine kritische, selbstständige und strukturierte Arbeitsweise sowie der Anspruch, wissenschaftliche Fragestellungen eigenständig weiterzuentwickeln
• Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit und am Austausch mit klinischen und wissenschaftlichen Kooperationspartnern
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
• Hohe Motivation zur wissenschaftlichen Weiterqualifikation und zur Durchführung einer Promotion.

Das bringt die Charité mit
Sie erwartet eine wissenschaftlich anspruchsvolle und abwechslungsreiche Tätigkeit in einer jungen, dynamischen Forschungsgruppe an der Charité. Sie arbeiten an einer hochaktuellen Fragestellung der translationalen Krebsforschung und erhalten die Möglichkeit, eigene wissenschaftliche Schwerpunkte zu entwickeln und Ihre Expertise kontinuierlich auszubauen. Dafür bieten wir Ihnen ein modernes wissenschaftliches Umfeld mit vielfältigen Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung:

• Eine wissenschaftlich anspruchsvolle Tätigkeit mit dem Ziel der Promotion
• Mitarbeit an einem von der Deutschen Krebshilfe geförderten, klinisch hochrelevanten Forschungsprojekt
• Arbeit mit modernen patientenabgeleiteten Organoidmodellen und innovativen Wirkstofftestungen
• Ein interdisziplinäres und international ausgerichtetes Forschungsumfeld mit enger Anbindung an klinische Fragestellungen
• Möglichkeiten zur Nutzung modernster Technologien und Core Facilities der Charité
• Eigenverantwortliches Arbeiten und die Möglichkeit, eigene wissenschaftliche Ideen einzubringen
• Unterstützung bei der Präsentation Ihrer Ergebnisse auf wissenschaftlichen Kongressen und bei der Publikation Ihrer Forschungsergebnisse
• Enge Betreuung und fachlicher Austausch innerhalb der Arbeitsgruppe sowie mit wissenschaftlichen Kooperationspartnern
• Möglichkeit zur Weiterentwicklung Ihrer experimentellen, bioinformatischen und wissenschaftlichen Kompetenzen.