Detailansicht des Stellenangebots

Das Leibniz-Institut für Neurobiologie (LIN) Magdeburg ist eine außeruniversitäre Forschungseinrichtung an der die neurobiologischen Mechanismen von Lernen und Gedächtnis erforscht werden. Mit einem breiten Spektrum an molekularbiologischer, tier- und humanexperimenteller Forschung und entsprechender Forschungs-infrastruktur bildet das LIN einen der Eckpfeiler der neurowissenschaftlichen Forschung in Magdeburg und der Leibniz-Gemeinschaft. Mit 250 Beschäftigten arbeiten wir national und international mit Universitäten, Forschungseinrichtungen und Unternehmen zusammen.

Die Arbeitsgruppe am Leibniz Institute für Neurobiologie in Magdeburg untersucht, wie Schlaf, Stress und sensorische Verarbeitung neuronale Schaltkreise im Gehirn verändern. Dabei nutzen wir larvale Zebrafische und Mäuse als Modellorganismus und kombinieren Verhaltensexperimente mit großskaliger in vivo Zwei-Photonen-Calcium-Bildgebung des gesamten Gehirns.

Ein zentraler Bestandteil unserer Forschung ist der offene neuroanatomische Referenzatlas Z-BRAIN, der als standardisierte Referenz für die Zebrafisch-Neurobiologie dient.

Zur Unterstützung unserer Arbeiten suchen wir eine motivierte Persönlichkeit mit starkem Hintergrund in wissenschaftlicher Programmierung und Bilddatenanalyse als

Forschungssoftwareentwickler/in / Postdoktorand/in (w/m/d) Research Software Engineer / Postdoctoral researcher (f/m/d)

„Analyse von Calcium-Imaging-Daten und Weiterentwicklung eines Zebrafisch-Hirnatlas“ “Analysis of calcium imaging data and further development of a zebrafish brain atlas”

Die Stelle, mit Bezahlung TV-L E 13 (100%), ist befristet für zwei Jahre. Ihre Anstellung und Sozialleistungen richten sich nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst der Länder (TV-L).

Ihre Aufgaben

• Entwicklung und Pflege von Software-Tools zur Analyse großskaliger Calcium-Imaging-Datensätze
• Weiterentwicklung und Erweiterung des offenen Zebrafisch-Gehirnatlas Z-BRAIN
• Implementierung und Optimierung von Registrierungsalgorithmen, um anatomische und funktionelle Bilddaten zuverlässig auf den Atlas abzubilden
• Entwicklung reproduzierbarer Datenanalyse-Pipelines in Python
• Unterstützung der Arbeitsgruppe bei der Organisation und Analyse großer Imaging-Datensätze
• Dokumentation und Veröffentlichung von Code als Open-Source-Software

Ihr Profil

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium Studium (Master) in Bioinformatik, Informatik, Computational Neuroscience, Physik oder einem verwandten Fach;
• Erfahrung im Umgang mit Z-BRAIN und Aufbereitung von Daten zur Einpflege in den Atlas
• Sehr gute Programmierkenntnisse in Python;
• Erfahrung mit wissenschaftlicher Bilddatenanalyse und großen Datensätzen;
• Kenntnisse in Bildregistrierung, Machine Learning oder Computer Vision sind von Vorteil;
• Interesse an neurobiologischen Fragestellungen und offenen wissenschaftlichen Softwareprojekten;
• Fähigkeit, sowohl selbstständig als auch im interdisziplinären Team zu arbeiten.

Wir bieten

• Mitarbeit an einem international sichtbaren Open-Science-Projekt für die Zebrafisch-Neurobiologie;
• Zugang zu modernsten in vivo Imaging-Technologien und großen Datensätzen;
• Ein interdisziplinäres Umfeld an der Schnittstelle von Neuroscience, Data Science und Softwareentwicklung;
• Möglichkeiten zur Weiterentwicklung eigener Softwareprojekte und wissenschaftlicher Zusammenarbeit;
• Ein internationales, kollaboratives Forschungsumfeld am Leibniz Institut für Neurobiologie in Magdeburg.

Wie bewerbe ich mich?

Bitte senden Sie Ihre vollständigen Bewerbungsunterlagen als einzelne PDF-Datei unter Angabe der Referenznummer LIN 2026/02 an bewerbung@lin-magdeburg.de mit folgenden Unterlagen:

• ein Motivationsschreiben, in dem Sie Ihren Forschungshintergrund, Ihre wissenschaftlichen Interessen und Ihre Karriereziele darlegen;
• **Lebenslauf **einschließlich einer Liste Ihrer Veröffentlichungen; sowie
• Kopien relevanter akademischer Zeugnisse.

Bewerbungsschluss ist der 24. März 2026.

Bei konkreten Fragen zur Stelle wenden Sie sich bitte an Hanna Zwaka (hanna.zwaka@lin-magdeburg.de).

Das LIN ist eine Stiftung des öffentlichen Rechts und verpflichtet sich zu einer umfassenden Strategie der Chancengleichheit in Beschäftigung und Forschung. Wir begrüßen alle Bewerbungen – unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität.

Wenn Sie einen internationalen Abschluss haben, fügen Sie Ihrer Bewerbung bitte auch eine Zeugnisbewertung der Zentralstelle für ausländische Bildungsabschlüsse (ZAB) bei. Wenn Sie noch keine Zeugnisbewertung haben, müssen Sie diese nach erfolgreicher Bewerbung beantragen. Weitere Informationen finden Sie unter https://www.kmk.org/zab/zeugnisbewertung.html.

Mit der Einreichung Ihrer Bewerbung erklären Sie sich mit der Verarbeitung Ihrer personenbezogenen Daten zum Zwecke des Bewerbungsverfahrens einverstanden. Unsere ausführliche Datenschutzerklärung für Bewerber (m/w/d) gemäß Art. 13 DSGVO zur Datenverarbeitung im Bewerbungsverfahren senden wir Ihnen auf Anfrage gerne zu. Wir weisen darauf hin, dass keine Bewerbungs- oder Interviewkosten erstattet werden können.