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Wir suchen zum 15.08.2026 befristet in Vollzeit (39,83 Std./Woche = 100 %) einen

Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (m/w/d) mit dem Schwerpunkt bioinformatische und statistische Modellierung und Vorhersage von Proteomics-Daten

Die Core Unit Bioinformatics - CUBiMed.RUB an der Medizinischen Fakultät bietet ein breites Spektrum an Bioinformatik-Ressourcen für Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler aus den Lebenswissenschaften. Als Core Unit bieten wir Beratung und Analysen, Schulungen und Tutorien, Software und Zugang zu leistungsstarker Hardware. Der Schwerpunkt liegt z. B. auf Proteomik und klinischen Forschungsdaten. Neben dem Anbieten bestehender Infrastruktur sollen auch Auswertemethoden weiterentwickelt und neue Services/Software Libraries angeboten werden.

Der Forschungsbereich ist an der Core Unit Bioinformatik „CUBiMed.RUB“ an der Medizinischen Fakultät beteiligt. CUBiMed.RUB bietet ein breites Spektrum an Bioinformatik-Ressourcen für Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler in den Lebenswissenschaften (Analysen, Schulungen und Tutorien, Software und Zugang zu leistungsstarker Hardware).

Umfang: Vollzeit
Dauer: befristet, 31.12.2027
Beginn: zum 15.08.2026
Bewerben bis: 15.06.2026

Ihre Aufgaben:

Im Rahmen der ausgeschriebenen Stelle soll die einzustellende Person verschiedene Services und Trainings im Bereich Bioinformatik der Proteomik anbieten:

• Tools: PIA (Protein Inference Algorithms): Toolbox für die Protein-Inferenz bei massenspektrometrie-basierten Proteomik-Daten; CalibraCurve: Tool für die Kalibrierung von targeted Proteomik-Messungen; Workflows: Bereitstellung von out-of-the-box Workflows (auch für unerfahrene Nutzer) für verschiedene Analysen im Bereich der Bioinformatik der Proteomik
• Datenbanken: MaCPepDB: Datenbank aller tryptischen Peptide aus UniProt
• Beratungsservices: Bioinformatik- und Statistik-Beratung und Analyseservice: Beratungen und Durchführen von Analysen im Bereich Bioinformatik der Proteomik; Statistik-Beratung und Analyseservice:
• Beratungen und Durchführen von Analysen bzgl. der statistischen Auswertung von Proteomik- und dazugehörigen klinischen Daten
• Weiterentwicklung vorhandener Services oder Neuentwicklung von Services / Software Libraries
• de.NBI Cloud Service: Bereitstellung von Workflows zur Bioinformatik der Proteomik in der de.NBI-Cloud und Beratung zur Nutzung
• Formulierung von Berichten und Mitarbeit an wissenschaftlichen Publikationen
• Nach ausführlicher Einarbeitung, selbstständiges Einarbeiten in weitere Themen in der Proteomik-basierten Bioinformatik wie weitere/neuere Peptid-Suchmaschinen/Quantifizierungs-Methoden
• Promotion

Ihr Profil:

• Erfahrung in der Analyse empirischer Forschungs- und klinischer Daten, vorzugsweise im Umfeld lebenswissenschaftlicher oder medizinischer Forschung
• Sehr gute Kenntnisse in statistischer Datenanalyse sowie sehr gute Programmierkenntnisse in R
• Gute Kenntnisse in Machine Learning
• Kenntnisse in Stan, Mplus
• Kenntnisse über „Deconvolution Problems“ und „Parsimonious Modelling“
• Sicherer Umgang mit LaTeX zur Erstellung wissenschaftlicher Dokumentationen
• Erfahrung im Umgang mit omics-, multi-omics- oder anderen datenintensiven Forschungsdaten
• Fähigkeit zur eigenständigen Konzeption, Umsetzung und Dokumentation komplexer Analyse- und Infrastrukturprozesse
• Erfahrung in universitären Forschungsprojekten
• interdisziplinären Arbeitsumgebungen inkl. intensiver Kommunikation mit klinischen Kooperationspartnern
• Erfahrung im Unternehmenskontext
• Grundkenntnisse in C/C++ oder SAS
• Hochschulabschluss mit einer Gesamtnote von mindestens 1,7
• Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

https://jobs.ruhr-uni-bochum.de/jobposting/199be5f2555c373bf33d86ddb0764fec69a50c630?ref=AfA