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ID: 26.144

Medizin

Computational Scientist oder Bioinformatikerin / Bioinformatiker (m/w/d)

Institut für Pathologie

Das Institut für Pathologie der Universität Regensburg hat neben Forschung und Lehre auch Aufgaben in der Krankenversorgung und betreut neben dem Universitätsklinikum mehrere Krankenhäuser in der Umgebung mit dem gesamten diagnostischen Spektrum einer Universitätspathologie.

EckpunkteBeginn:

zum nächstmöglichen Zeitpunkt

Umfang:

40h / Woche*

Vergütung:

TV-L E13

Befristung:

befristet für 2 Jahre*

Wir bieten:

• Eine abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit in einem modernen, forschungsaktiven molekularpathologischen Diagnostiklabor
• Ein motiviertes Team mit Freude an der Weiterentwicklung innovativer molekularer Sequenziermethoden
• Eine gründliche Einarbeitung in bestehende Arbeitsabläufe und Methoden
• Flache Hierarchien und kurze Entscheidungsprozesse
• Eine hervorragende Arbeitsatmosphäre in einem freundlichen Team
• Exzellente Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Flexible Arbeitszeiten zur Unterstützung der Vereinbarkeit von Familie und Beruf
• Vermögensanstalt des Bundes und der Länder (VBL)
• Jährliche Sonderzahlung
• Vermögenswirksame Leistungen
• Jobticket und mehr

Ihre Aufgaben:

• Etablierung und Validierung neuer bioinformatischer Workflows und Analysetools für die Implementierung von Nanoporen-Sequenzierung in Forschung und molekularpathologischer Diagnostik
• Durchführung von bioinformatischen und statistischen Analysen molekularer Daten einschließlich single cell und bulk NGS-Assays
• Weiterentwicklung bestehender bioinformatischer Workflows und Analysetools für die Auswertung komplexer Sequenzierungsdaten (z.B. im Bereich Einzelzellsequenzierung oder Integration von Multiomics-Daten)
• Unterstützung von Forschungsprojekten mit der Auswertung von High-throughput-Daten (u.a. RNAseq, Epigenomik, WGS/WES, scDNAseq, scRNAseq und Integration mit spatial transcriptomics Daten)
• .Arbeiten in einem interdisziplinären Team aus Bioinformatikern, Datenwissenschaftlern, Biologen und Ärzten
• Zusammenarbeit mit nationalen und internationalen Kooperationspartnern
• Veröffentlichung von Ergebnissen in internationalen Fachzeitschriften und auf nationalen und internationalen Tagungen

Ihr Profil:

• Vorausgesetzt wird ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master oder vergleichbar) der Bioinformatik oder verwandter Fachrichtungen
• Eine vorhandene Promotion ist optional, ggf. besteht auch im Rahmen der Anstellung die Möglichkeit zur Promotion
• Erfahrung in statistischen Datenanalysen und Programmierkenntnisse (z.B. R, Python, C++, Bash/Shell) sowie Kenntnisse von Workflow-Management-Systemen (z.B. Snakemake, CWL, Nextflow)
• Kenntnisse und Erfahrungen in der praktischen Anwendung der Standard-Bioinformatik-Tools zur Analyse und Interpretation von Next Generation Sequencing (NGS) Daten
• Hohe Eigenmotivation und die Fähigkeit Forschungsprojekte unabhängig und in Kollaborationen mit multidisziplinären Teams voranzubringen
• Kommunikationsfähigkeit sowie Freude am Arbeiten in einem Team
• Ein hohes Maß an Engagement, Zuverlässigkeit und Verantwortungsbewusstsein

Die Universität Regensburg strebt eine Erhöhung des Frauenanteils an und fordert daher qualifizierte Frauen ausdrücklich zur Bewerbung auf. Die Universität Regensburg setzt sich besonders für die Vereinbarkeit von Familie und Beruf ein (nähere Informationen unter https://www.uni-regensburg.de/universitaet/jobs-und-karriere/familien-service).

Bei im Wesentlichen gleicher Eignung werden schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber bevorzugt eingestellt. Bitte weisen Sie auf eine vorliegende Schwerbehinderung ggf. bereits in der Bewerbung hin.

Bitte beachten Sie, dass wir Kosten, die bei einem etwaigen Vorstellungsgespräch für Sie anfallen sollten, nicht übernehmen können.

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Kontakt:

Für Auskünfte stehen Ihnen Frau Prof. Dr. med. Daniela Hirsch (E-Mail: <daniela.hirsch@ur.de>/Telefon: 0941 944-6643) oder Herr Prof. Dr. rer. nat. Wolfgang Dietmaier (E-Mail: <wolfgang.dietmaier@ur.de>/Telefon: 0941 944-6624) zur Verfügung. Bewerbungen sind mit üblichen Unterlagen bis spätestens 13.07.2026 ausschließlich über den unten stehenden Bewerbungsbutton möglich.

• Hinweise zur Befristung und zum Stellenumfang

Befristung für die Dauer des Projekts "Implementierung von Nanoporen-Sequenzierung in der molekularpathologischen Diagnostik und Entwicklung der zugehörigen Analysepipelines zur Datenprozessierung und -auswertung". Eine Verlängerung wird angestrebt.

Die Stelle ist teilzeitgeeignet, sofern durch Jobsharing die ganztägige Wahrnehmung der Aufgaben gewährleistet ist.