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Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter

Erregersurveillance (d/m/w)

Werden Sie Teil der RKI-DNA!

Das Robert Koch-Institut - das sind ca. 1.500 Köpfe aus über 52 Nationen mit
einem Ziel: Die Gesundheit der Menschen zu schützen. Wir erheben und
analysieren Gesundheitsdaten, erkennen Risiken, beraten Politik und Fachwelt
und entwickeln neue wissenschaftliche Methoden. Unsere Standorte sind in
Berlin, Wildau und Wernigerode.

Unser Team MF 1 – Genom-Kompetenzzentrum freut sich auf Ihre Bewerbung!

Das Genom-Kompetenzzentrum etabliert zentrale bioinformatische Prozesse für
die integrierte genomische und metagenomische Erregersurveillance. Das Team
Genomische Epidemiologie arbeitet an der Analyse und Etablierung von
Hochdurchsatzsequenzdaten an der Schnittstelle von genomischer Surveillance und
Umweltsurveillance.

Ihre Aufgabe bei uns

• Unterstützung, Durchführung und Weiterentwicklung bioinformatischer
  Analysen im Bereich der genomischen und metagenomischen Erregersurveillance
• Weiterentwicklung von Datenvisualisierungen, Dashboards und explorativen
  Anwendungen zur Analyse und Darstellung genomischer Surveillance-Daten
• Aufbau, Strukturierung und nachhaltige Organisation von Datenmanagement-
  und Datenhaltungssystemen für reproduzierbare wissenschaftliche Analysen
• Mitarbeit in Forschungsprojekten

Ihr Profil

Formale Voraussetzungen

• ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium
  (Universitätsdiplom, Master) im Bereich Informatik, Bioinformatik, Software
  Engineering, Data Science oder in einer vergleichbaren Fachrichtung

Bei ausländischen Bildungsqualifikationen benötigen wir einen Nachweis über
die Gleichwertigkeit mit einem deutschen Abschluss.

Kenntnisse und Erfahrungen

• im Betriebssystem: Linux
• in Programmiersprachen: Bash, Python/R
• in Infrastruktur: Git, Conda/Singularity/Docker, Snakemake/Nextflow
• in HPC (z.B. SLURM)
• in NGS-Daten Auswertung (z.B. Illumina, ONT)
• sicherer Umgang mit den gängigen MS-Office-Programmen
• Sprachkenntnisse (CEFR-Niveau): Deutsch mind. C1, Englisch mind. B1

Wünschenswerte Kenntnisse und Erfahrungen:

• im Bereich reproduzierbarer Analysen und kollaborativer Entwicklung
  (Research Software Engineering)
• im Bereich Datenvisualisierung (z.B. Rshiny, Auspice)
• in mikrobieller Genomik (z.B. phylogenetische Analysen, metagenomische
  Sequenzanalysen, SNP-basierte Analysen)
• mit Jira, Confluence, Bitbucket, GitHub

Persönliche Kompetenzen

• Lernfähigkeit und -bereitschaft mit dem Ziel der schnellen Einarbeitung in
  neue Aufgaben
• Innovationsbereitschaft durch das Einbinden neuer Erkenntnisse in
  bestehende Überlegungen und Ziele
• Selbstständigkeit und eigenverantwortliches Arbeiten nach Zielvorgaben
• Kooperations- und Teamfähigkeit und Erarbeitung von Lösungen zusammen mit
  anderen Teammitgliedern
• Kommunikationsfähigkeit und anschauliche Darstellung von Sachverhalten
  sowie präziser und sachlicher Argumentation
• Networking und Kooperation in bereichsübergreifende Teams

Weitere Voraussetzungen

• Bereitschaft zur Teilnahme an einer erweiterten Sicherheitsüberprüfung nach
  § 9 Sicherheitsüberprüfungsgesetz (SÜG) sowie deren positiver Abschluss

Darauf können Sie sich freuen

• bis zu 50 % mobile Arbeit möglich
• flexible Arbeitszeiten mit Gleitzeit und Teilzeitmöglichkeiten
• individuelle Fortbildungsmöglichkeiten und ein breiter Trainingskatalog für
  die persönliche Weiterentwicklung
• Sportangebote, wie Yoga, Laufveranstaltungen, Kooperationen mit Fitness
  Studios u.v.m.

Haben wir Ihr Interesse geweckt?

Wir freuen uns auf Ihre aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen ausschließlich
überinteramt.de zur StellenID 1462210.

Wir leben Chancengleichheit und gewährleisten die berufliche Gleichstellung.
Bewerbungen von Menschen in allen Dimensionen von Diversität sind ausdrücklich
erwünscht. Schwerbehinderte Menschen werden bei gleicher Eignung, Befähigung
und fachlicher Leistung bevorzugt berücksichtigt.

Das Bundesministerium für Gesundheit kann im Rahmen seiner
aufsichtsrechtlichen Befugnisse im Einzelfall Einblick in Ihre
Bewerbungsunterlagen nehmen. Ihre personenbezogenen Daten werden nach Abschluss
des Bewerbungsverfahrens gelöscht.

Nicht der richtige Job für Sie? Hier finden Sie mehr: jobs.rki.de.

Bitte bewerben Sie sich auf dieses Stellenangebot online über www.interamt.de, Stellen-ID= 1462210. Der Link unten führt sie zu der Seite.