Wissenschaftlicher Mitarbeiter (m/w/d)

Die Medizinische Fakultät der Universität Leipzig gehört mit ihrer über 600jährigen Tradition zu den größten Forschungseinrichtungen der Region Leipzig. Mit über 1.300 Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern ist sie die größte von insgesamt 14 Fakultäten der Universität Leipzig und dient als Ausbildungsstätte für ca. 3.500 Studierende der Human- und Zahnmedizin sowie der Pharmazie und Hebammenkunde.
Wir suchen eine:n Clinical Data Scientist / Clinical NLP Scientist für den Aufbau einer lokalen, datenschutzkonformen Clinical-NLP-/LLM-Plattform zur Verarbeitung von Daten aus der klinischen Routine unserer Klinik.
Im Zentrum stehen die nachvollziehbare Extraktion klinischer Text- und Verlaufsmarker aus klinischer Routinedokumentation als Grundlage longitudinaler Phänotypisierung, die Entwicklung validierter Goldstandard-Datensätze und die perspektivische Verknüpfung mit digitalen Biomarkern aus Sprache, Video, Eye-Tracking oder HRV.
Ziel ist eine Infrastruktur, die klinische Arbeit und Forschung verbindet: bessere Fallübersichten, strukturierte Versorgungspfade und eine effiziente Nutzung von Routinedaten zur transdiagnostischen Subphänotypisierung und personalisierten Behandlungsplanung. Perspektivisch zielt die Plattform darauf, durch die Verknüpfung von Routinedaten mit digitalen Biomarkern die diagnostische Qualität zu verbessern und den Prozess effektiver zu gestalten.
Ihre Aufgaben

• Aufbau und wissenschaftliche Nutzung einer lokalen On-Premise-NLP-/LLM-Infrastruktur auf vorhandener GPU-Hardware der Klinik
• Entwicklung pseudonymisierter, reproduzierbarer Dokumentenpipelines für klinische Routinetexte inkl. RAG-Systemen mit Quellenbelegen
• Aufbau und Validierung klinisch definierter Text- und Verlaufsmarker jenseits reiner ICD-Kodierung gegen Goldstandard und externe Anker
• Planung von Annotationsstudien mit ärztlich-psychologischen Rater:innen
• Perspektivische Verknüpfung textbasierter Phänotypen mit Sprach-, Audio-, Video- und Physiologie-Markern
• Betreuung von Abschluss- und Qualifizierungsarbeiten
• Entwicklung eigener Projektideen und Mitwirkung an der Einwerbung von Drittmitteln

Ihr Profil

• Promotion abgeschlossen oder eingereicht in Medizininformatik, Clinical Data Science, Informatik, Computerlinguistik, Data Science oder verwandten Fächern
• Sicherer Umgang mit Python-basierten Daten-/ML-Pipelines, SQL, Linux-Umgebungen, Git und containerisiertem Arbeiten
• Erfahrung mit NLP-/LLM-Workflows, Embeddings, RAG, strukturierter Extraktion oder Evaluation generativer Modelle
• Erfahrung mit wissenschaftlichen Publikationen; Interesse an Drittmittelentwicklung und eigenständiger methodischer Profilbildung
• Ausgeprägte analytische und kommunikative Fähigkeiten sowie Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit mit Klinik, IT, Datenschutz und Forschung
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift; selbstständige, ergebnisorientierte Arbeitsweise, hohe Eigenständigkeit und Teamfähigkeit
• Von Vorteil: Kliniktexte, De-Identifikation/Pseudonymisierung, FHIR/OMOP, MLOps, Statistik, Longitudinaldaten oder multimodale Forschungsdaten

Einrichtung: Department für Frauen- und Kindermedizin, Klinik und Poliklinik für Psychiatrie, Psychotherapie und Psychosomatik des Kindes- und Jugendalters
Anstellungsart: Befristet 31.12.2028
Arbeitsdauer: Vollzeit (40,00h)
Arbeitsbeginn: zum nächstmöglichen Zeitpunkt
Vergütung: TV-L

• einen modernen Arbeitsplatz und attraktive Arbeitsbedingungen (Mobile Arbeit)
• flexible Arbeitszeiten sowie die Vereinbarkeit von Familie und Beruf
• ein vergünstigtes Personennahverkehrsticket (MDV-JobTicket)
• Attraktives Forschungsumfeld in einem engagierten klinisch-wissenschaftlichen Team, mit vielfältigen klinischen und biologischen Daten sowie lokaler GPU-Infrastruktur, u. a. RTX PRO 6000 Blackwell
• Einbettung in ein laufendes Forschungsprogramm zu digitaler Phänotypisierung
• Enge Zusammenarbeit mit lokalen und überregionalen klinischen und wissenschaftlichen Kooperationspartner:innen, u. a. Medizininformatik, Datenschutz, IT und Kliniken
• Möglichkeit zur eigenständigen wissenschaftlichen Profilbildung mit Habilitations- bzw. Qualifizierungsperspektive

Bitte bewerben Sie sich jetzt bis zum 18.08.2026 auf diese Stelle in unserem Bewerberportal.

Auskünfte zum Bewerbungsverfahren erteilt Prof. Dr. med. Georg v. Polier (E: Georg.vonPolier@medizin.uni-leipzig.de).

Schwerbehinderte Bewerber:innen werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Bitte fügen Sie Ihrer Bewerbung entsprechende Nachweise bei.
Bitte beachten Sie, dass wir aufgrund gesetzlicher Regelungen nur Bewerber:innen einstellen können, die über die Immunität gegen Masern verfügen. Die entsprechenden Nachweise müssen von Ihnen vorgelegt werden.
Hinweise zum Datenschutz finden Sie unter: Datenschutz